cambio de formato de todos los archivos del ipod

Alguna veces cuando conecto el ipod al ordenador me dice que no puede leer la información, desconecto y siempre pasa lo mismo, me dice que no hay musica, no hay fotos ni podcast ni nada, voy a la barrita donde te pone por colores la cantidad de espacio ocupado por cada cosa y sale todo en naranja, vamos como si le cambiase el formato a todo lo que hay dentro del ipod y no reproduce nada, tengo que restaurar ( perdiendo todo ) y vuelta a empezar.. ya em ha apsado un par de veces y me dijeron que podia ser por meter discos sin itunes pero solo lo hago con itunes... gracias