En diferentes foros de Nike+ se han presentado quejas de usuarios que intentaron usar el servicio con iOS 4. Entre los problemas más comunes se reportaron perdidas de información sobre sesiones de ejercicio y la perdida de conexión con los sensores Nike + o los controles remotos Nike+.
La mayoría de las quejas pertenecen a usuarios de iPods touch o de iPhones 3Gs aunque no faltó el ocasional caso de usuarios del nuevo modelo de iPhone. Otros de los problemas registrados incluyen: que los clicks se tomen como dobles haciendo inútil cualquier función de reproducción/pausa; sincronizaciones que toman un tiempo extremadamente largo y terminan perdiendo información y volúmenes exageradamente altos en los auriculares.
En general los expertos en Nike + están refiriendo los problemas a Apple pero recomiendan también resetear todos los settings del dispositivo de Apple; un reinicio forzado y una serie de toques rápidos en el sensor (y no uno sólo largo) así como también un re-link del sensor.