La tercera generación del iPod shuffle, el modelo más chico de los reproductores de Apple, se destaca porque no solo por no tener una pantalla, sino que tampoco posee una rueda de control sensible al tacto. A diferencia de las generaciones anteriores y siguiente, el iPod shuffle de tercera generación (3G) tiene los controles en el cable de los auriculares. Todos los demás modelos utilizan una rueda de control con botones.
La tercera generación del iPod shuffle fue lanzada en Marzo de 2009. Este iPod es tiene aproximadamente la mitad del tamaño que el shuffle anterior, lo que lo hace realmente muy pequeño.
Actualmente Apple ofrece al iPod shuffle de tercera generación con una capacidad de 2GB o 4GB y en colores negro, plata, rosa, verde y azul. También existe una edición especial de acero inoxidable y con una capacidad de 4GB. El cuerpo de este iPod shuffle es alargado y el frente está totalmente vacío. La caras posterior posee un clip integrado que puede usarse para engancharlo de una prenda de la misma forma que el iPod shuffle de segunda generación. Este iPod no posee controles salvo por el interruptor de encendido, los controles han sido movidos al cable de los auriculares.
El iPod shuffle 3G posee una característica llamada VoiceOver que le permite hablar y decir el nombre de la canción y artista que se está escuchando y también enumera las listas de reproducción disponibles. La característica VoiceOver del iPod shuffle está disponible en 14 idiomas distintos.
Los controles están ubicados en el cable del auricular derecho. Los controles constan de tres botones, dos para subir y bajar el volumen y un botón central para controlar la reproducción y el resto de las funciones del iPod shuffle.
Su capacidad de 4GB es suficiente para almacenar unas 1000 canciones codificadas a 128Kbps., y la batería incluida en este iPod tiene una duración de hasta 10 horas.
La tercera generación de iPod shuffle está disponible en color negro, plata, verde, rosa o azul con un precio sugerido de venta al público EE.UU. de U$s 79 para el modelo de 4GB y u$s 59 para el modelo de 2GB. La edición especial de iPod shuffle de acero inoxidable y 4Gb de capacidad está disponible sólo a través de iTunes Store por u$s 99